江孜战役以后，7月14日英军又向拉萨进发。这时西藏抗英斗争的形势发生了变化，有领导有组织的武装抵抗已接近尾声，西藏地方政府中的妥协投降派的势力抬头，噶厦政府在他们的压力下，向西藏军民发出了停止抵抗的命令，并派出噶伦等僧俗官员为谈判代表，要求与英军在途中谈判，劝阻英军不要进入拉萨。但是这时的莱赫鹏，完全撕下他是来与驻藏大臣和西藏的代表谈判通商和边界问题的“和平使节”的伪装，根本不理睬西藏方面发出的和谈的呼吁，一心要打到拉萨。

英国侵略军侵入拉萨城

    7月31日，英军在曲水渡过雅鲁藏布江，在这紧急关头，十三世达赖喇嘛带领少数随从逃离拉萨，翻越唐古拉山，经柴达木盆地和安西，前往外蒙古。达赖喇嘛行前任命甘丹赤巴洛桑坚赞为代理摄政，由噶伦和三大寺代表等辅助，办理政务。8月3日，英军占领了拉萨。清朝在十三世达赖喇嘛离开拉萨后，按照驻藏大臣有泰的奏请，宣布将达赖喇嘛的名号“暂行革去”。